Sustav osiguravanja kvalitete (SOK) na Stomatološkom fakultetu (SFZG) uspostavljen je temeljem Zakona o znanstvenoj djelatnosti i visokom obrazovanju, Zakona o osiguravanju kvalitete u znanosti i visokom obrazovanju, Statuta SFZG-a, Pravilnika o sustavu osiguravanja kvalitete SFZG-a te Standarda i smjernica osiguravanja kvalitete Europskog prostora visokoga obrazovanja.
SFZG promiče kulturu kvalitete u svim aspektima njegove djelatnosti, znanstvenom, stručnom i nastavnom radu u skladu s misijom i vizijom te ostvarivanjem strateških ciljeva.
Odgovornost za SOK na SFZG-u u nadležnosti je dekana i Fakultetskog vijeća. Odbor za upravljanje kvalitetom predlaže aktivnosti i mjere te nadzire uspostavu i provedbu SOK-a. Na provedbenoj razini SOK-om upravlja prodekan za kontrolu kvalitete. SOK na Fakultetu nadzire Ured za upravljanje kvalitetom Sveučilišta u Zagrebu, Odbor za upravljanje kvalitetom Sveučilišta u Zagrebu te resorni prorektor.
U provođenju aktivnosti i mjera upravljanja kvalitetom uključene su sve razine sudionika i djelatnika SFZG-a, od studenata, suradnika, nastavnog i nenastavnog osoblja do administrativnog i tehničkog osoblja te vanjskih suradnika.
Kontinuirano vrjednovanje kvalitete svih djelatnosti provodi se na više načina, od anketa, samovrjednovanja i unutarnjeg vrjednovanja, do vanjskog vrjednovanja reakreditacijom koju provodi Agencija za znanost i visoko obrazovanje.
Glavni postupci u promicanju kulture kvalitete na SFZG-u su planiranje (godišnji plan aktivnosti), provedba (edukacija djelatnika, provedba planiranih aktivnosti), provjera (prikupljanje povratnih informacija, samovrjednovanje, analiza uspješnosti, unutarnja/vanjska prosudba, godišnje izvješće) te unaprjeđenje (razvoj aktivnosti, aktualiziranje postupaka, izmjene u dokumentima i aktivnostima).